Microarray

Ein Microarray ist ein Glasträger oder Silizium-Chip mit einer Bibliothek (eine Sammlung von DNA-Sequenzen) von einzelsträngigen DNA-Fragmenten, die auf seiner Oberfläche verteilt wird.  Die Grösse der Bibliothek kann sehr gross von 1000 bis 150.000 in Bezug auf die hochdichtesten Träger sein.  Die Reihe von einzelsträngigen auf der Oberfläche verteileten DNA-Fragmenten sind als die Proben bekannt, und diese können wie eine Folge von Flecken oder Quadraten auf einem Raster geordnet werden, abhängig vom gewählten Verfahren zur Stellung der DNA.

DNA Flecken ergeben sich auch aus Roboterdruck mit Stiften oder einem Ink-Jet Drückern, und die in-situ Erstellung der DNA wird Quadraten erschaffen, wie in Affymetrix-Chips angezeigt.  Die DNA Bibliothek kann auf vielfältige Weise erschafft werden, entweder als komplementäre DNA (cDNA), die aus den Zellen als messenger RNA (mRNA) entnommen und sequenziert werden, um Expressed Sequence Tags (ESTs) zu erschaffen, oder als syntetische DNA-Sequenzen, die als oligionucleotides (oligios) bekannt sind.  Oligios einer gegebenen Länge sind oft als n-mers bekannt, zum Beispiel ein oligionucleotide von 25 Basen – wie die, die auf Affymetrix Chips verwendet werden – ist ein 25-mer….informieren Sie mehr über Microarray-Analyse und Versuchsplanung in GenStat in der Dokumentation

Microarray Fähigkeiten von GenStat

Finden Sie heraus, wie John Wass von Scientific Computing über die Microarray analytische Techniken denkt.

Microarray Beispieldateien

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13ten Ausgabe

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Veröffentlichungsdatum: 13ten Juli 2010
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12ten Ausgabe

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Veröffentlichungsdatum: 20sten Juli 2009
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11ten Ausgabe

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Veröffentlichungsdatum: 17ten Juni 2008
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10ten Ausgabe

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Veröffentlichungsdatum: 17ten Juni 2008
Downloadgrösse: 75 MB

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